自動更新でエクセルの内部ハイパーリンクが全滅

エクセル2007（オフィス2007）を利用しています。OSはｖｉｓｔａUL。

夜間に自動更新を設定していました。更新完了後の再起動のダイアログに気付かなかったみたいで、作業中にいきなりそれぞれのウィンドが閉じて、再起動してしまいました。ほとんどのファイルは上書き保存無しで、それまでの作業データは失われました。

再起動後、再起動前に開いていたエクセルのブック内に設定してあったハイパーリンクのうち、内部リンクが全て上書きされて全滅してしまいました。

外部URLへのハイパーリンクは書き換えられていませんでした。

書き換えは、相対リンクに以下の文字列が書き加えられていました。

..\..\AppData\Roaming\Microsoft\Excel\相対リンク

赤字が追加された文字列です。当然、リンクは機能しません。なぜこんな事が起こったのでしょう？